2001年12月，电子信息学院与电力学院合并，成立电子信息与电气工程学院，电力学院改为电气工程系。

    电气工程系源于1908年的电机工程学院，具有悠久的历史，曾经培养出一大批国内外有影响的杰出人才。培养出诸如江泽民总书记和一大批在政府，企业和科研院所担任领导和专家地人才。
    1987年，能源部（后电力部，现电力工业总公司）与上海交通大学联合办学，大力建设有关电力系统的学科，建立了上海交通大学电力学院。学院由电力工程、电机工程、能源工程、信息与控制工程4个系组成。1998年，根据学科建设需要，能源工程系归并动力与能源工程学院。1999年，学院进行内部体制改革，电力工程、电机工程2个系合并为电气工程系。
　　电气工程学科的前身为建于1908年的电机电工学科，1952年正式建立电力工程系。1960年本学科点开始招收研究生，1981年成为国内高校中首批有权授予硕士学位的学科之一；1993年，该学科点获得博士学位授予权，1996年被评为上海市教委重点学科；1999年，被批准成立电气工程一级学科博士后流动站，2000年电气工程获一级学科博士学位授予权。
　　现在，电气工程系下设五个所，有电力系统及其自动化、电机与电器、高电压与绝缘技术、电力电子与电力拖动, 电工理论与新技术五个研究所；有电气工程、电工及电子技术两个实验中心；设有电气工程一级学科博士点、博士后流动站、有电机与电器、电力系统及其自动化、高电压与绝缘技术、 电力电子与电力传动、电工理论与新技术五个二级学科博士点及硕士点；电气工程与自动化本科专业。
　　电气工程系现有工程院士2人，正副教授72名，其中，45岁以下的教授4名；在读博士后12名，博士研究生52名，硕士研究生280名，本科生1131余名。从1999年起，电气工程系设立了电气信息工程试点班，参照国外著名大学的培养模式和教育体系，着力培养高素质、宽口径、具有创新精神的人才。电气工程系培养的毕业生适应性强，可在电力系统、信息工程领域、电气设备设计、控制和企业自动化等部门以及在研究机构、高等院校及企业与公司从事科研、教学、开发和管理等工作。
　　近年来，电气工程系对高新技术在电力系统各领域中的应用及学科前沿技术等方面做了大量的研究工作，着力于加强实验基地及计算机网络和通信系统的建设、新型电力电子技术应用、新数学理论在电力系统信号分析中的应用、努力培养具有坚实理论基础和高新专业技术水平的博士后、博士、硕士研究生和本科生。
　　电气工程系取得了丰硕的教学、科研和人才培养成果："液电冲击波体外粉碎肾结石技术"获国家科技进步一等奖，"医用核磁共振CT"获广东省科技进步一等奖，"平面型载体催化可燃气体检测元件"获国家发明奖，"800千伏冲击电压发生器"、"WXH35型微机短路保护装置"、"50-750W工频试验变压器成套设备"、"上海市浦东新区城市电网发展规划研究"、"前列腺增生射频热疗仪"等30多个项目分获上海市和部委级科技进步奖。学院重视理论教学，重视对学生实践能力和适应能力的培养，1995年、1997年连续获得"全国大学生电子设计竞赛"一等奖，在此基础上，1999年获得全国大学生电子设计竞赛第一名，夺得全国最高奖--"索尼杯"大奖。（---更多科技成果）
　　电气工程系在产业化方面也进行了卓有成效的工作，电气工程系是交通大学唯一一个覆盖强电、弱电的学院，有5个研究所，两个实验中心，两个工程中心。能够解决电力系统和通信领域的很多问题。产品转化项目，如消弧线圈自动调谐系列企业产值上亿元。高电压试验设备系列1984年成立"高压设备开发中心"，在江苏江都成立生产厂，目前产品覆盖全国70％左右的市场，多次获科技进步奖。肾结石粉碎机，国家科技进步一等奖，教育部科技进步一等奖。进校科研经费2千多万元，产品出口到南美，产生了较大国际影响。医用核磁共振CT。产品转让到广东威达公司，目前已经成为上市公司。进校经费360万元，开发成功后，产值数亿元。前列腺热疗仪，体内式1993年开发成功，产生利润近千万元，体外式技术出口日本，转让费55万美元，作为技术出口日本在国内是少见的。其它的产品如劣质绝缘子检测仪，真空开关真空度检测装置等等也产生较大的产值。
　　电气工程系拥有很好的教学、科研基地。电工学实验中心为面向全校的教学试验基地，有动模实验设备，3000kV冲击电压发生器，1000kV工频实验变压器，20kA出击电流发生器，100MHz到－1GHz泰克示波器，任意波形发生器多台。
　　现有的各研究方向已建成结构合理的梯队， 今后将以"基础研究带动学科发展，国民经济需要引导研究方向"为宗旨，以培养高质量的人才，出高水平的成果为目标，积极与国内外企业合作，以完成国家级项目为基础，充分利用地处上海的优势，为上海市的电力有关行业甚至华东、全国电力有关行业的发展作贡献。将在灵活交流输电技术，电力系统绝缘设备在线检测，通信与控制，电机电器技术，电力系统低频振荡和大型汽轮发电机和电网耦合作用等方面作进一步研究；在电力市场中定价，竞价上网和有关电力市场操作中经济补偿以及区域电力市场等问题作进一步探讨；完成电力网络规划方案的成本效益分析与评价工作；进一步将模糊数学、神经网络及小波方法等应用于电力系统的信号处理的研究等。
　　电气工程系获得学校985项目经费2000多万元，获得很好的发展机遇。电气工程系的广大教职员工将在21世纪在铸辉煌。